北京中医药大学东方医院建立于1986年，于1999年12月12日正式营业，是北京中医药大学第二临床医学院，地方中医药管理局直管机构，地方中医临床研究建设单位，是一所特色显著、功能完善、机器设备先进，集诊疗、教学、科学研究、防治和健康咨询为一体的三级甲等中医医院，是国家教育部211工程建设的中医药大学附院，北京医保定点医疗机构。
2011年6月，北京中医药大学东方医院正式接收北京市二七机车厂医院，改名为北京中医药大学东方医院西院区(二七分院)。2015年5月25日东方医院正式签约大兴区南院区，改名为北京中医药大学东方医院南院区。北京中医药大学东方医院现为一院三区：即东方医院方庄院区、东方医院二七分院(二七院区)、东方医院南院区。北京中医药大学东方医院总占地面积5.68万平方，建筑面积12.45万平方。
